Snemma sveppaeyðir voru ólífræn efnasambönd, þar á meðal eru brennisteinsduft og koparblöndur (sjá Bordeaux blöndu) enn notuð í dag. Árið 1914 notaði I. Reem frá Þýskalandi fyrst lífræn kvikasilfurssambönd til að hafa hemil á hveiti, sem markaði upphaf þróunar lífrænna sveppaeyða.
Árið 1934 uppgötvuðu WH Tisdale og fleiri í Bandaríkjunum bakteríudrepandi eiginleika dímetýldíþíókarbamats. Síðan þá hafa lífræn sveppalyf tekið að þróast hratt. Það eru þrjár meginraðir af lífrænum brennisteinssveppalyfjum sem þróuð voru á fjórða og fimmta áratugnum: thirams, dysons (eins og sink dysons) og tríklórómetýlþíódmetýlkarboxímíð. Að auki hefur lífrænt klór, lífrænt kvikasilfur, lífrænt arsen sveppaeitur einnig verið þróað. Flest þessara sveppalyfja eru verndandi efni og hafa takmarkanir í notkun.
Síðan á sjöunda áratugnum hafa fleiri efnafræðilegar tegundir sveppalyfja komið fram og mikilvægustu framfarirnar eru tilkoma kerfisbundinna sveppaeyða.
Árið 1965 þróaði Japan lífræna fosfór sveppalyfið Daobenjing. Árið 1966 þróuðu Bandaríkin wisterin. Árið 1967 þróuðu Bandaríkin benomýl. Árið 1969 þróaði Japan þíófanat. Trísýklasól var þróað í Bandaríkjunum árið 1977, metalaxýl var þróað í Sviss og áltríetýlfosfat var þróað í Frakklandi árið 1978. Kerfisefnin sem eru táknuð með ofangreindum hafa orðið meginstraumur þróunar sveppalyfja síðan á áttunda áratugnum. Á sama tíma hafa sýklalyf í landbúnaði þróast hratt. Lífrænt kvikasilfur, lífrænt arsen og sum lífræn klórsveppaeitur eru smám saman að hætta vegna eiturhrifa eða umhverfismengunar. Nýja kynslóð kerfisbundinna lyfja hefur stækkað enn frekar markaðinn fyrir sveppalyf vegna bættra stjórnunaráhrifa þeirra. Á níunda áratugnum voru meira en 200 afbrigði af sveppum. Samkvæmt könnuninni, árið 1985, nam sala sveppaeiturs í heiminum 2,54 milljörðum Bandaríkjadala, sem er 18,4 prósent af heildarsölu varnarefna.
Árið 1984 nam sala kerfisbundinna lyfja í sveppalyfjum 44,2 prósentum og ókerfisbundinna efna 55,8 prósentum. Í nærri hálfa öld hefur þróun sveppalyfja aðallega beinst að efnum til varnar og meðhöndlunar sveppasjúkdóma, á meðan rannsóknir og þróun efna til að fyrirbyggja og meðhöndla sjúkdóma af völdum baktería og veira eru enn ófullnægjandi. Síðan 1950 hefur Kína aðallega þróað sveppaeyðir. Síðan á áttunda áratugnum hefur það byrjað að þróa kerfisbundin sveppalyf og sýklalyf í landbúnaði og hefur hætt að nota lífræn kvikasilfursefni. Vegna þess að notkunartækni sveppaeiturs er tiltölulega flókin er þróunarhraði ekki eins mikill og skordýraeitur. Hins vegar hefur verndandi áhrif sveppalyfja á landbúnaðarframleiðslu verið meira og meira viðurkennt af bændum. Með nútímavæðingu landbúnaðar í Kína mun þróun sveppalyfja óhjákvæmilega hraða.